در اجلاس دبیران شورای امنیت کشورهای عضو سازمان شانگهای (چین، روسیه، هند، پاکستان، قزاقستان، قرقیزستان، تاجیکستان، ازبکستان، بلاروس و ایران) که در بیشکک قرقیزستان برگزار شده بود، با تلاش چشمگیر هیئت ایرانی، چهار محور از منافع ملی کشورمان در بیانیه پایانی مورد تاکید و حمایت اعضاء قرار گرفت. 
نمایندگان هیئت اعزامی جمهوری اسلامی ایران از شورای عالی امنیت ملی، اصرار داشتند که موارد زیر به‌گونه‌ای روشن و با صراحت در بیانیه پایانی گنجانده شود. این چهار مورد عبارتند از:
۱- محکومیت صریح حمله نظامی آمریکا و رژیم صهیونیستی به جمهوری اسلامی ایران در جنگ رمضان.
۲- محکومیت ترور مقامات عالی جمهوری اسلامی به‌ویژه امام شهید خامنه‌ای و دبیر شورای عالی امنیت ملی. گفتنی است نام رهبر شهیدمان با تاکید هیئت ایرانی به‌صورت کامل و با عنوان «‌آیت‌الله سید علی خامنه‌ای‌» در بیانیه ذکر شده است. 
۳- محکومیت اعلام و انتساب عنوان تروریست به نیروهای مسلح کشورهای عضو شانگهای که 
بر اساس قانون اساسی شکل گرفته‌اند. منظور هیئت شرکت‌کننده کشورمان در اجلاس شانگهای، محکومیت این اقدام علیه سپاه پاسداران انقلاب اسلامی بوده است و تاکید بر این واقعیت که انتساب عنوان تروریست به سپاه، اقدامی معارض با حقوق بین‌الملل است.
۴- در بیانیه پایانی اجلاس شانگهای حمله به تأسیسات هسته‌ای صلح‌آمیز کشورها (و از جمله ایران‌) محکوم شده است 
 گفتنی است در اجلاس دبیران شورای امنیت کشورهای عضو سازمان شانگهای، دکتر باقری ریاست هیئت را بر عهده داشت.